Jusqu'à ses douze ans, Daisuke Niwa était un petit garçon comme les autres, secrètement amoureux d'une fille de sa classe, Risa Harada. Mais tout change à son douzième anniversaire : et d'une, il déclare sa flamme à Risa qui le rejette, et de deux, il apprend par sa mère qu'il est destiné à accueillir l'âme de Dark, un célèbre voleur d'objets d'art. Du coup, chaque soir, alors que ses petits camarades vont tous se coucher pour avoir une bonne nuit de sommeil réparateur, Niwa, possédé par l'âme de Dark, va voler les oeuvres les mieux gardées dans les musées les plus prestigieux ; et ce avec une facilité déconcertante, d'autant plus qu'il prend soin de prévenir la police avant de commettre ses infractions.
Seulement, dès sa première sortie nocturne, Dark/Niwa passe devant la maison de Risa. En apercevant Dark, Risa tombe tout de suite amoureuse du mystérieux voleur (qui n'est autre que Niwa, si vous suivez bien). Et pour combler le tout, Dark se retrouve nez à nez avec Riku, soeur jumelle de Risa et tombe lui aussi sous son charme. Cette même Riku sera peu à peu séduite par le charme discret de Niwa. Ce quadrilatère amoureux (qui n'est en fait qu'un triangle amoureux car Dark et Niwa ne sont qu'une seule et même personne) sera le moteur de toute l'histoire de D.N Angel.
A partir de là, beaucoup a déjà été dit. Est-il nécessaire de préciser que très vite Niwa trouvera en la personne de Satochi Iwatara un alter ego de taille ? En effet, bien qu'agé de douze ans lui aussi (il est bien entendu dans la classe du héros), Satochi fait déjà partie des forces de police, et se révèlera être le seul de taille à poser problème à Dark.